Byakugan (jap. 白眼, dosł. "białe oczy"?) występuje u członków klanu Hyūga. Podobnie jak sharingan zlokalizowany jest w tęczówce. Kiedy byakugan jest aktywny, w okolicach oczu użytkownika pojawiają się żyły, a w naturalnie białych oczach pojawia się obwódka źrenicy. Byakugan umożliwia widzenie we wszystkich kierunkach jednocześnie, dostrzeganie ataków z odległości 50 metrów oraz wewnętrznego źródła czakry przeciwnika. Umożliwia trafienie w tenketsu (punkty na ciele, wielkości główki szpilki, przez które wyzwalana jest czakra), co pozwala na zatrzymanie lub przyspieszenie przepływu czakry. Byakugan bardzo dobrze radzi sobie ze śledzeniem ruchów przeciwnika.

Posiadacze byakugana
Członkowie klanu Hyūga (m.in. Hiashi Hyūga, Hinata Hyūga, Neji Hyūga)
Ao – Ninja z Kiri Gakure
Hyōton  [edytuj]
Hyōton (jap. 氷遁, dosł. "uwolnienie lodu"?) – Ta zaawansowana więź krwi pozwala na nieograniczoną kontrolę nad wodą i wiatrem. Dzięki temu możliwa jest fuzja tych żywiołów, której rezultatem jest lód. Posiadacz hyōton może dowolnie kształtować lód wedle własnej woli.

Posiadacze hyōton
Haku
Kekkei genkai Ranmaru  [edytuj]
Pozbawione nazwy kekkei genkai, którego nosicielem jest Ranmaru z wioski Kiri. Kiedy użytkownik korzysta z tej mocy jego oczy jarzą się na czerwono. To kekkei genkai umożliwia widzenie przez ściany i przedmioty dookoła głowy. Technika ta pozwala także dostrzec wewnętrzne systemy kontroli czakry i wykonać ich kopie w stworzonych przez siebie klonach.

Mokuton  [edytuj]
Mokuton (jap. 木遁, dosł. "uwolnienie drewna"?) – unikatowa zdolność Pierwszego Hokage z klanu Senju oraz Yamato. polegająca na zamianie swej czakry w energie życiową. Yamato posiadł ją dzięki eksperymentom, które przeprowadzał na nim Orochimaru.

Posiadacze mokuton
Pierwszy Hokage
Yamato
Rinnegan  [edytuj]
Rinnegan (jap. 輪廻眼, Rinnegan? dosł. "oko Samsary") jest najpotężniejszą z trzech wielkich technik wzrokowych (jap. 瞳術, dōjutsu?). Rinnegan charakteryzuje się szarymi obwódkami wokół źrenicy oka.

Posiadacze rinnegana
Rikudō Sennin (jap. 六道仙人, dosł. "Xian sześciu światów"?)
Pain
Satetsu  [edytuj]
Umiejętność Trzeciego Kazekage Wioski Piasku. Dzięki temu, że potrafił zmieniać swoją chakrę w pole magnetyczne, mógł manipulować miliardami drobinek żelaza. Mógł także z nich formować kształty i bronie o dowolnej wielkości. Ta umiejętność została uznana za najsilniejszą i najgroźniejszą w całej historii Wioski Piasku.

Posiadacze satetsu
Trzeci Kazekage
Sharingan  [edytuj]

SharinganSharingan (jap. 写輪眼, dosł. "kopiujące oko"?) wywodzi się z linii krwi byakugan. Występuje wśród klanu Uchiha. Sharingan daje posiadaczowi kilka przydatnych umiejętności: zwiększenie szybkości reakcji, umiejętność rozróżnienia wroga wśród stworzonych przez niego klonów lub iluzji. Unikatową zdolnością sharingana jest możliwość skopiowania ruchów przeciwnika, a co za tym idzie każdej widzianej przez niego techniki. Dzięki temu ninja może posługiwać się wieloma technikami bez potrzeby ich trenowania. Sharingan nie jest w stanie skopiować technik typu kekkei genkai.

cztery poziomów sharingana 
Poziom pierwszy – pojawia się zaraz po "przebudzeniu" umiejętności. Na oczach pojawia się jedna/dwie "łezki". Ten poziom pozwala dostrzegać zjawiska niewidoczne gołym okiem – obiekty poruszające się z dużą szybkością, przepływ czakry, a także w pewnym stopniu przenikać wzrokiem przez przedmioty. Może kopiować inne techniki.
Poziom drugi – W oku pojawiają się trzy "łezki". Zwiększa podstawowe umiejętności.
Poziom trzeci – Mangekyō Sharingan (jap. 万華鏡写輪眼, dosł. "kalejdoskopowy sharingan"?). To unikalny poziom sharingana. Kształt jest różny u każdego posiadacza. Aby go osiągnąć, należy wyzwolić niezwykle silne emocje (zazwyczaj negatywne). Stopniowo osłabia wzrok i w efekcie doprowadza do ślepoty.
Poziom czwarty – wieczny Mangekyō Sharingan (jap. 永遠の万華鏡写輪眼, eien no mangekyō sharingan?, dosł. "wieczny kalejdoskopowy sharingan). Ten poziom nie niesie ze sobą ryzyka oślepnięcia oraz zwiększa umiejętności.

Posiadacze sharingana
Członkowie klanu Uchiha (m.in. Sasuke Uchiha, Itachi Uchiha, Obito Uchiha, Madara Uchiha)
Kakashi Hatake
Danzō
Mangekyō sharingan Itachiego 
Itachi Uchiha osiągnął trzeci poziom sharingana poprzez zamordowanie swojego najlepszego przyjaciela, Shisui Uchihy. Dzięki temu jest w stanie wykonać nowe, potężne techniki:

Tsukuyomi (jap. 月読, Tsukuyomi?)
Amaterasu (jap. 天照, Amaterasu?)
Susanoo (jap. 須佐能乎, Susanoo?).
Shikotsumyaku  [edytuj]
Shikotsumyaku (jap. 屍骨脈, Shikotsumyaku?) – Kekkei genkai, którego posiadaczami byli członkowie klanu Kaguya. Wszyscy posiadali bardzo twarde, wręcz niezniszczalne kości. Uzyskiwali zdolność dowolnego nimi manipulowania. Mogli wyciągać kości poza organizm. Wytwarzali z nich broń i używali ich do obrony i bezpośredniego ataku.

Posiadacze shikotsumyaku
Członkowie klanu Kaguya (m.in. Kimimaro Kaguya)
Shōton 
Shōton – zaawansowana więź krwi, która pozwala na krystalizację materii dookoła użytkownika. Posiadaczką tej umiejętności jest Guren.

Posiadacze shōton
Guren


Sōma no Kō
Sōma no Kō (jap. 双魔の攻, dosł. "agresja pary demonów"?)- Kekkei genkai, którego posiadaczami są Sakon i Ukon. Ta więź krwi pozwala na połączenie na poziomie molekularnym swego ciała albo jej części z innym członkiem klanu. Z ciała użytkownika w każdej chwili i z każdego miejsca może wyrosnąć część ciała osoby połączonej. Sōma no Kō umożliwia także połączenie ciała z ciałem przeciwnika. Jeśli połączeni ninja zostaną zranieni, to obrażeniom ulegną narządy obydwu z nich.

Posiadacze Sōma no Kō
Sakon i Ukon